หลังจากที่แอเรียล และอิริคได้ให้กำเนิดบุตรสาว เมโลดี้ พวกเขาทั้งสองต้องพบกับคำขู่อาฆาตจากน้องสาวเออร์ซูล่า ที่ชื่อ มอร์กาน่า หล่อนเปี่ยมไปด้วยความเคียดแค้น ถึงขนาดออกปากจองเวรกับแอเรียลว่าจะลักพาตัวเมโลดี้ไป สัญชาตญาณของความเป็นแม่ จึงต้องลุกขึ้นปกป้องลูกสาวให้พ้นอันตราย ด้วยการปิดบังฐานะที่แท้จริงของนางเงือก และออกคำสั่งให้เมโลดี้อยู่ไกลจากทะเลให้มากที่สุด แต่แล้วเมโลดี้ก็ขัดคำสั่งด้วยความฝันในการเป็นเงือกน้อย เธอบังเอิญพบกับมอร์กาน่าที่แปลงกายมาหลอกเป็นผู้วิเศษ ให้พรในวันครบรอบวันเกิด แล้วแผนของแม่มดชั่วก็เป็นจริงเมื่อหล่อนจับเมโลดี้เป็นตัวประกัน เพื่อแลกกับการเป็นเจ้าแห่งท้องทะเล แอเรียลจึงต้องกลับไปขอความช่วยเหลือจากเพื่อนเก่าอย่างซาแบสเชี่ยน ฟลาวเดอร์ และสกัดเติล เพื่อชิงตัวลูกสาวกลับคืนมา และทำให้ครอบครัวกลับมามีความสุขกันอีกครั้ง